应激性腹泻是一种功能性肠道疾病，主要由5-羟色胺(5-HT)与微生物相互作用介导的肠-脑轴失调引起。肠道内容物与肠黏膜的微生物群属于两个不同的群落系统，而他们在应激性腹泻中的作用尚不清楚。为了明确二者在组成和潜在功能上的差异，研究者利用PacBio对小鼠的肠道内容和黏膜进行16srRNA基因全长测序，用细菌物种丰度数字建模方法，分析两种微生物群落系统与血清5-HT浓度之间的相关性。
主要结果
结果表明，肠道内容物和黏膜的微生物成组差异，随分类分辨率水平不断提高。与内容物相比，肠黏膜中定植的微生物群对应激性腹泻更为敏感。PICRUSt2分析发现，应激性腹泻更容易扰乱肠黏膜微生物群参与的神经反应。进一步分析发现，通过建立机器学习模型和多元降维方法，粘膜微生物群的相对丰度对血清5-HT浓度具有更强的预测性(R2=0.)。这些发现提示，肠粘膜微生物群可能作为一种新预测模型，用于预测血清5-HT在应激性腹泻中的作用。
图1应激性腹泻在物种水平上显著扰乱了肠道菌群的多样性和组成
图2基于KEGG数据库的功能预测
图3建立了一个基于细菌相对丰度的5-HT浓度预测模型
参考文献
GutMicrobiotaComparisonBetweenIntestinalContentsandMucosainMiceWithRepeatedStress-RelatedDiarrheaProvidesNovelInsight.
FrontiersinMicrobiology,.
Doi:10./fmicb..
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