益生菌株很多，主要分为4类：乳杆菌类、双歧杆菌类、革兰氏阳性球菌、酵母菌。
常见的菌株主要有下面9种：
1、枯草芽孢杆菌
枯草芽孢杆菌能够帮助人体食物消化，提高肠胃功能，减少消化系统疾病的出现。
2、植物乳杆菌
植物乳杆菌是人体肠道正常微生物菌群的组成部分，可以从人体肠腔、胃和十二指肠分离出来。它可以促进营养物质的吸收，调节肠道菌群平衡，增强免疫力。
3、双歧杆菌
双歧杆菌能够增强肠道系统的免疫功能，同时提高肠道对营养物质的吸收和消化，还具有抗肿瘤的作用。
4、保加利亚乳杆菌
保加利亚乳杆菌是酸奶中最常用的菌种之一，它具有调节胃肠道健康、促进消化吸收、增加免疫功能等生理功能。
5、嗜热链球菌
嗜热链球菌广泛用于生产一些重要的发酵乳制品、包括酸奶和奶酪。它具有改善肠道功能、激活人体免疫系统、延缓衰老等功能。
6、干酪乳杆菌
干酪乳杆菌有调节肠内菌群平衡、促进人体消化等作用。另外，还有高效降血压、降胆固醇，促进细胞分裂、缓解乳糖不耐、缓解过敏等作用。
7、鼠李糖乳杆菌
鼠李糖乳杆菌是目前公认的好菌种之一，属于乳杆菌的代表菌。它具有定植能力强、减少内毒素、保护胃粘膜、预防便秘与腹泻的特点。
8、丁酸梭菌
丁酸梭菌可以促进肠道内的双歧杆菌、乳酸杆菌等益生菌的生长，抑制有害菌、腐败菌的繁殖，从而调整肠道菌落平衡。
9、酵母菌
酵母菌可促进肠道菌群平衡，增加人体免疫力，另外，酵母菌中的强抗氧化物和矿物质，有排毒养颜和抗衰老的作用。